Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD1Q99460 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms