Protein–RNA interactions for Protein: Q91VR2

Atp5c1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5c1Q91VR2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5c1Q91VR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp5c1Q91VR2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5c1Q91VR2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms