Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.3 ms