Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms