Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp20Q8C6M1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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