Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Iffo1Q8BXL9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms