Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx17Q8BVL3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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