Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms