Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a3Q6PIC6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp1a3Q6PIC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a3Q6PIC6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms