Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2810408A11RikQ6NSU2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms