Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw2Q6I6G8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw2Q6I6G8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms