Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms