Protein–RNA interactions for Protein: Q62441

Tle4, Transducin-like enhancer protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle4Q62441 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tle4Q62441 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle4Q62441 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms