Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2dQ60773 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms