Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms