Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc160Q3UYG1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms