Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a11Q3USY0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a11Q3USY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms