Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hectd3Q3U487 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms