Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc2cQ3TLH4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms