Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms