Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDC1Q14676 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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