Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB2Q08289 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB2Q08289 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms