Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc1P97496 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms