Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vgll3P85442 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vgll3P85442 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms