Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms