Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms