Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-24P63145 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms