Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UFM1P61960 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UFM1P61960 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UFM1P61960 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UFM1P61960 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UFM1P61960 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms