Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tac1P41539 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac1P41539 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac1P41539 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms