Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VhlP40338 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VhlP40338 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VhlP40338 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VhlP40338 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VhlP40338 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VhlP40338 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VhlP40338 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VhlP40338 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms