Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stfa3P35173 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stfa3P35173 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms