Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms