Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb2P21619 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb2P21619 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms