Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB1P19838 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms