Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1bP0C7A0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms