Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms