Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
H2-Eb1P04230 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-Eb1P04230 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms