Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccl20O89093 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl20O89093 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Ccl20O89093 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccl20O89093 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms