Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cops3O88543 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops3O88543 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms