Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtogO55225 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtogO55225 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtogO55225 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtogO55225 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtogO55225 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtogO55225 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtogO55225 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtogO55225 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OtogO55225 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtogO55225 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtogO55225 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtogO55225 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtogO55225 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms