Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbnO55189 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbnO55189 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbnO55189 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbnO55189 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbnO55189 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AmbnO55189 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbnO55189 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms