Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms