Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grcc10O35127 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grcc10O35127 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms