Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata2O09100 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata2O09100 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata2O09100 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms