Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm5798F7BTS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5798F7BTS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms