Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8005F6YKY3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8005F6YKY3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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