Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10378F6XQQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10378F6XQQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm10378F6XQQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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