Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm8247F6VRJ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms