Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12cD3Z3L3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12cD3Z3L3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms