Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930467E23RikD3Z1P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930467E23RikD3Z1P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms